Dahulu Desa Gunungsari merupakan penggabungan dari 2 Desa yaitu Desa Wangklu dan Desa Kauripan sejak tahun 1901, berdasarkan hasil musyawarah diberi nama DESA GUNUNGSARI yang terdiri dari 4 Dusun, Yaitu Dusun GRUNGGUNG, Dusun GANANG, Dusun TLEKEN, sedangkan Desa KAURIPAN menjadi Dusun KRAJAN yang sekaligus menjadi pusat pemerintahan pada saat itu.

Sejak tahun 1901 sampai dengan 1944 dipimpin oleh Mbah SURO WIJOYO, pada tahun 1945 sampai dengan 1978 di jabat oleh Bapak LANDUNG HADI WIJOYO, tahun 1978 sampai 1981 Kepala Desa dijabat oleh Bapak SOEROSO HADI dan pusat pemerintahan pindah ke Dusun GRUNGGUNG. Tahun 1981 sampai dengan Tahun 2002 di jabat oleh Bapak GATOET A.H. dan pusat pemerintahan pindah lagi ke Dusun KRAJAN. Tahun 2002 sampai dengan 2012 Kepala Desa di jabat oleh Bapak SJA’RONI S.Ag. Tahun 2012 sampai dengan tahun 2017 di jabat oleh Bapak BAKRI. Tahun 2017 sampai dengan tahun 2018 di jabat oleh Bapak ALI MUKSAN dan sejak tanggal 13 Desember tahun 2018 kepala desa Gunungsari dijabat oleh Bapak ANDY WIDYANTORO Sampai Sekarang.